内科：
神经内科：1，复旦大学附属上海华山医院；2，复旦大学附属上海中山医院；3，复旦大学附属儿科医院
心内科： 1，复旦大学附属上海中山医院；2，复旦大学附属上海新华医院；3，复旦大学附属上海华山医院
消化内科：1，上海交大附属仁济医院；2，复旦大学附属上海中山医院；3，上海交大附属瑞金医院
呼吸内科：1，上海交大附属新华医院；2，第二军医大附属长海医院；3，同济大学附属上海同济医院
内分泌科：1，上海交大附属瑞金医院；2，上海交大附属仁济医院；3，同济大学附属上海同济医院
血液内科：1，上海交大附属瑞金医院；2，上海交大附属新华医院；3，第二军医大附属长海医院
肾内科： 1，上海交大附属瑞金医院；2，复旦大学附属上海华山医院；3，上海中医药大学附属曙光医院
风湿免疫：1，上海交大附属仁济医院；2，复旦大学附属上海华山医院；3，上海中医大学附属曙光医院
传染病科：1，复旦大学附属上海华山医院；2，上海交大附属新华医院；3，上海交大附属瑞金医院
中西医结合科：1，复旦大学附属上海华山医院；2，上海中医大学附属卢湾中西医结合医院；3，第二军医大附属长征医院.

外科：
神经外科：1，复旦大学附属上海华山医院；2，第二军医大附属上海长征医院；3，上海交大附属仁济医院
普外（肝胆）：1，复旦大学附属上海中山医院；2，第二军医大附属东方肝胆医院；3，同济大学附属上海同济医院
普外（胃肠）：1，复旦上学附属上海中山医院；2，同济大学附属上海同济医院；3，上海交大附属新华医院
泌尿外科：1，复旦大学附属上海华山医院；2，上海交大附属仁济医院
胸心外科：1，复旦大学附属上海中山医院；2，第二军医大附属长征医院；3，上海交大附属新华医院
传统骨科：1，上海交大附属第六人民医院；2，第二军医大附属长海医院；3，复旦大学附属上海华山医院
脊柱外科：1，第二军医大附属长海医院；2，第二军医大附属长征医院；3，复旦大学附属上海华山医院
血管外科：目前没有发现上海特别强的血管外科，二军大的附属医院应该都不错
手外科：复旦大学附属上海华山医院（全国第一）
烧伤外科：1，上海交大附属瑞金医院；2，上海交大附属第九人民医院
整形外科：1，上海交大附属第九人民医院（全国第一）.