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印尼种族及宗教冲突的祸源：帝国主义干预
印尼的宗教不和谐问题是冰冻三尺非一日之寒，近年来伊斯兰教徒向基督及天主教会摩擦生事的事件不断，在安汶等地，许多教徒被杀，教堂被毁坏，导致相互仇杀，连放学回家的基督教徒女学生，也被对方用刀砍成身首异离，宗教引起的治安问题，一直是干扰该地社会发展的毒瘤
债有主、冤有头，印尼的宗教与种族矛盾历来已久，一方面和某些伊斯兰教派社会出现背离伊斯兰教义，排斥异教的习惯势力有关。另一方面要记在帝国主义的账上。英国、葡萄牙、荷兰、日本等帝国主义国家入侵占领过印尼，组成殖民政府，他们丰富的欧美强国的政治经验，令印尼这些滞后民族就范，深厚的殖民主义文化沉淀，高明的治理手段，简直把殖民地臣民玩于股掌之上。
荷兰统治印尼300年，其殖民军队不可能全部来自荷兰，于是采取爪哇人派到安汶，安汶人派到苏门答腊的隔离政策，使利用他们人生地不熟，不必照顾面子, 便于严厉执政进一步巩固其殖民统治。
同时还重用加入天主教或基督教的安汶(Ambon)人、马达(Batak)人，提拔他们为军官，去镇压造反的马来族或爪哇族人。一箭双雕之下，民族不合及宗教分裂兼而有之，这手段反复使用，日久生功。
荷兰人鼓励华人多从事生意，改善生活及社会地位后，进入上流社会，一些忠于荷兰的侨领,被委任为甲必丹(Kapitan)、雷珍兰(Letnan)、马腰(Mayor)等官职，利用华人统治华人。还刻意培养高等华人圈子，其子女都读荷兰学校，加入天主教或基督教，使其俨然以二等公民阶层自居。不明就里的高等华人圈子自视其高, 他们当然和印尼人格格不入，甚至歧视印尼人,两族隔阂逐渐生成难解。
所以，独立后印尼人掌权，所有华人被印尼人认为是荷兰的附庸, 虽然不公平, 但华人首当其冲不可避免成为整肃目标, 印尼政府多次通过的报复性法令，均对华人不利, 就由此开始埋下限制华人、仇视华人祸根
殖民政府工于心计，造成在宗教方面的倾轧效果，可以从邦加槟港(Pangkal Pinang,Bangka)的关帝庙的情况见其一斑。
当时有200多年历史的关帝庙，旁边修建一条马路，庙的左边地角正好挡住马路，本来可以切掉，但荷兰人认为大可不必，让马路为地角让路，形成一条马路被庙宇拦腰卡住一角儿不完整的情况，使土著为之侧目。
到日本人南侵后，挑拨阴谋玩得更加淋漓至尽，他们暗地里支持印尼独立运动，让印尼人把目标引向被指为亲荷的华人；一方面又以防范印尼人的打砸抢为由，挑拨华人组建保安队。
同时在独立运动风起云涌时，告诉印尼人:华人保安队是荷兰的雇佣军走狗，准备向你们动手。所以印尼人与华人的猜疑自那时就开始，尽管不少华人有识之士, 如萧玉璨等参加独立革命，出钱出力甚至不惜献出生命。
至于美国，在印尼独立之后，是代替荷兰的新殖民主义者。他们在朝鲜战争后, 感到在亚洲必须遏制共产主义的崛起，控制军队架空苏加诺之同时，加强对穆斯林组织教派的渗透，将其塑造为最反共、反华的强大政治力量，既使苏加诺背腹受敌, 又使印尼共产党遭受肘制。
但是，人算不如天算，当初为支援阿富汗塔利班反抗苏联入侵的战争，美军也为印尼培养不少游击队员加入阿富汗战争，有迹象表明,1998年5月13日的印尼反华骚乱的主导者正是这些人, 杀伤力超强, 非常冷血, 所以华人被害得很惨。(这笔血债早晚要偿还的!)
但在美军镇压塔利班及入侵伊拉克后，印尼的极端穆斯林分子全部归顺反美的拉登的基地组织，并发动巴厘岛及雅加达万豪酒店及澳大利亚大使馆的爆炸事件。事情的发展，正是和萨达姆与拉登原来是美国中央情报局豢养的猎犬，后来反咬其主子的情况一样。印证了毛主席所说的：“帝国主义搬起石头砸自己的脚。”.
