我也做代理业的，业务和你不同。
开发票的时候，明细开清楚。服务费*****元、代交****款****元。可以开同一张发票，也可以分2张开。
申报的时候营业税有个表六，要填这个表格，发票号码、日期，开票金额，本期应减除金额。填完后表的电子签名串上方出来一个汇总金额；
然后填表一，第6列有个应税减除项目金额把表六的合计填上去就可以了。出来的就是你的应纳税营业额
注意，你开具的每一张发票都要填列上去的，如果该张发票没有税前减除的款项，那么最后一列的本期应减除金额栏填0..

1、发票号码填写你公司开具的发票。你收到的代交款项的发票是你发生的成本
2、代交款是不是行政事业性收费，如果是开客户公司抬头，那么你收到客户的这部分资金入账的时候作为其他应付款入账，并且这部分发票的费用你公司不用开发票给对方了。对方付给你的服务费作为预收款或则收入入账。对方付给的总额=服务费（你开具的发票金额）+代交款（收到的代交款发票）
另外就是代交款开你自己公司的抬头，那么客户打给你的费用，全部进收入或则预收款。开发票的时候把代交款和你们收的服务费明细分别列清，表六上最后一列把代交款填列上去。收到的代交款发票作为成本
3、表7是系统自动生成的
4、收到客户费用，先作为预收款入账。我认为账务简单点就是代交款你交掉后收到代交款发票后再把预收款发票开给客户。这样当月发生收入当月发生成本。
   如果你收到款项当月开发票给客户，而代交款隔月再交，那么你得先计提成本，暂估成本，等收到发票再冲回，比较麻烦。
   另外 当月在系统申报所有开出去的发票。申报是按照开票情况申报的，而不是实际发生的金额。表6的 合计数字和表3的营业收入应该等于你开票系统里当月的开票总额。  表一的税前可扣除金额等于表6的最后一列可 扣除金额合计数。  即使该张发票无税前可扣除金额也要填列上去。你的发票号码除了作废的应该是连号的。

有什么问题，你短我吧。大家共同学习。

[ 本帖最后由 龙凤胎的妈妈 于 2010-12-18 18:45 编辑 ].

也填写，这样申报纳税表一到表七数据都是对应的，也和你开票系统的数据对应。
表六把本月开具的所有发票都要做上去的
下月申报的时候，你有问题打电话给我吧，联系方式已经短你了。.