我的理解是，首先要看公司性质，是一般纳税人还是小规模纳税人。按照年营业收入是否超过500W。
小规模纳税人的话，是按照应税收入的*3%来缴纳VAT的。
一般纳税人就复杂点，首先分扣额和扣税。

扣额就是你说的差额征税，成本发票的总额可以抵扣VAT.范围一般是海外的运输服务费和代理费，或者是同行的VAT专用发票。
扣税则是按照收到的成本发票不同类型来抵扣VAT进项，一般税率有6%，7%和11%。

希望能帮到你。.

小规模纳税人是不能享受扣额和扣税的。.